软件包：covtobed（1.3.5+dfsg-2 以及其他的）

[ 源代码： covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

其他与 covtobed 有关的软件包

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 armel, armhf]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 标准 C++ 库，第3版

• dep: zlib1g

  压缩库 - 运行时

下载 covtobed

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
amd64	1.3.5+dfsg-2	49.8 kB	146.0 kB	[文件列表]
arm64	1.3.5+dfsg-2+b1	45.0 kB	147.0 kB	[文件列表]
armel	1.3.5+dfsg-2	42.8 kB	125.0 kB	[文件列表]
armhf	1.3.5+dfsg-2	44.6 kB	97.0 kB	[文件列表]
i386	1.3.5+dfsg-2	53.4 kB	149.0 kB	[文件列表]
mips64el	1.3.5+dfsg-2	46.4 kB	215.0 kB	[文件列表]
ppc64el	1.3.5+dfsg-2	49.7 kB	210.0 kB	[文件列表]
riscv64	1.3.5+dfsg-2+b1	48.2 kB	111.0 kB	[文件列表]
s390x	1.3.5+dfsg-2	46.3 kB	138.0 kB	[文件列表]