Paket: covtobed (1.3.5+dfsg-2 och andra)

[ Källkod: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Andra paket besläktade med covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: zlib1g

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta covtobed

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.3.5+dfsg-2	49,8 kbyte	146,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.3.5+dfsg-2+b1	45,0 kbyte	147,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.3.5+dfsg-2	42,8 kbyte	125,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.3.5+dfsg-2	44,6 kbyte	97,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.3.5+dfsg-2	53,4 kbyte	149,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.3.5+dfsg-2	46,4 kbyte	215,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.3.5+dfsg-2	49,7 kbyte	210,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.3.5+dfsg-2+b1	48,2 kbyte	111,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.3.5+dfsg-2	46,3 kbyte	138,0 kbyte	[filförteckning]