[ 源代码： libssw ]
软件包：ssw-align（1.2.5-1 以及其他的）
试制（Experimental）软件包
警告：这个软件包来自于 experimental 发行版。这表示它很有可能表现出不稳定或者出现 bug ，甚至是导致资料损失。请务必在使用之前查阅 changelog 以及其他潜在的文档。
Smith-Waterman aligner based on libssw
This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.
其他与 ssw-align 有关的软件包
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]
- GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libssw1 (= 1.2.5-1) [除 riscv64]
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
- dep: libssw1 (= 1.2.5-1+b1) [riscv64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 压缩库 - 运行时
下载 ssw-align
| 硬件架构 | 版本 | 软件包大小 | 安装后大小 | 文件 |
|---|---|---|---|---|
| alpha （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 22.0 kB | 84.0 kB | [文件列表] |
| amd64 | 1.2.5-1 | 19.1 kB | 52.0 kB | [文件列表] |
| arm64 | 1.2.5-1 | 17.5 kB | 83.0 kB | [文件列表] |
| armel | 1.2.5-1 | 20.8 kB | 55.0 kB | [文件列表] |
| armhf | 1.2.5-1 | 19.5 kB | 47.0 kB | [文件列表] |
| i386 | 1.2.5-1 | 23.5 kB | 71.0 kB | [文件列表] |
| ia64 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 26.8 kB | 77.0 kB | [文件列表] |
| m68k （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 19.9 kB | 59.0 kB | [文件列表] |
| mips64el | 1.2.5-1 | 21.5 kB | 85.0 kB | [文件列表] |
| ppc64 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 23.3 kB | 84.0 kB | [文件列表] |
| ppc64el | 1.2.5-1 | 20.5 kB | 84.0 kB | [文件列表] |
| riscv64 | 1.2.5-1+b1 | 22.9 kB | 53.0 kB | [文件列表] |
| s390x | 1.2.5-1 | 23.1 kB | 60.0 kB | [文件列表] |
| sh4 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 24.9 kB | 83.0 kB | [文件列表] |
| sparc64 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 22.1 kB | 1,044.0 kB | [文件列表] |
| x32 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 18.8 kB | 51.0 kB | [文件列表] |