Пакунок: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 and others)

[ Source: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, User Interface: interface::commandline, role::program, Purpose: Analysing

Інші пакунки пов'язані з fastqtl

• dep: libblas3

  Реалізації основних підпрограм лінійної алгебри (колективна бібліотека)

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Бібліотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  Бібліотека параметрів програми на Сі++

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: r-mathlib (>= 4.4.1)

  GNU R standalone mathematics library

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  Пакунок недоступний

• rec: r-cran-tools

  Пакунок недоступний

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Завантажити fastqtl

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
i386	2.184+v7+dfsg-4+b3	234.8 kB	769.0 kB	[список файлів]