Paquet : fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 et autres)
Liens pour fastqtl
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source fastqtl :
- [fastqtl_2.184+v7+dfsg-4.dsc]
- [fastqtl_2.184+v7+dfsg.orig.tar.xz]
- [fastqtl_2.184+v7+dfsg-4.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Dylan Aïssi (Page QA)
- Étienne Mollier (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [fastqtl.sourceforge.net]
Paquets similaires :
mappage de LCQ (locus de caractères quantitatifs) dans cis pour les phénotypes moléculaires
Le but de FastQTL est d’identifier les polymorphismes d'un seul nucléotide (SNP) qui sont associés de façon significative avec différents phénotypes moléculaires (c.-à-d. l’expression de gènes connus, les niveaux de méthylation de la cytosine, etc). Il réalise des analyses pour toutes les paires phénotype-variante dans cis (c.-à-d. les variantes à l’intérieur d’une fenêtre particulière autour d’un phénotype). FastQTL met en œuvre un nouveau schéma de permutation (approximation Bêta) pour précisément et rapidement corriger les génotypes et phénotypes pendant des tests multiples.
Autres paquets associés à fastqtl
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- dep: libblas3
- implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée
- ou libblas.so.3
- paquet virtuel fourni par libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)
- bibliothèque Boost.Iostreams
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- dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)
- bibliothèque d'options de programmes pour C++
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libstdc++6 (>= 14)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: r-mathlib (>= 4.4.1)
- bibliothèque mathématique autonome de GNU R
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- rec: r-cran-argparser
- GNU R command-line argument parser
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- rec: r-cran-qvalue
- Paquet indisponible
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- rec: r-cran-tools
- Paquet indisponible
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- sug: fastqtl-doc
- QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation
Télécharger fastqtl
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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i386 | 2.184+v7+dfsg-4+b3 | 234,8 ko | 769,0 ko | [liste des fichiers] |