Пакунок: zalign (0.9.1-4)

[ Source: zalign  ]

parallel local alignment of biological sequences

zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.

zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.

Інші пакунки пов'язані з zalign

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [not armhf]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 4.9)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

Завантажити zalign

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	47.1 kB	279.0 kB	[список файлів]
arm64	44.7 kB	263.0 kB	[список файлів]
armhf	26.1 kB	97.0 kB	[список файлів]
i386	47.9 kB	265.0 kB	[список файлів]