Пакунок: abyss (2.1.5-7)

[ Source: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Tags: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Інші пакунки пов'язані з abyss

• dep: bsdmainutils

  Колекція деяких утиліт від FreeBSD.

• dep: libc6 (>= 2.28)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2)

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Колективна бібліотека SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: make

  Утиліта управління компіляцією

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

Завантажити abyss

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
i386	2,960.8 kB	9,334.0 kB	[список файлів]