Pacote: abyss (2.1.5-7)

[ Fonte: abyss  ]

montador sequencial, paralelo, de novo para leituras curtas

ABySS é um montador paralelo, sequencial, 'de novo', concebido para leituras curtas. Pode ser utilizado para montar dados de sequência de genoma ou transcritoma. A paralelização é conseguida utilizando MPI, OpenMP e pthread.

Etiquetas: Campo: Biologia, Implementado em: C, Interface de usuário(a): Linha de comando, Função: Programa

Outros pacotes relacionados a abyss

• dep: bsdmainutils

  coleção de mais utilitários do FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.28)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2)

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  biblioteca compartilhada SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: make

  utilitário para compilação direta

• dep: openmpi-bin

  biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

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