Пакунок: bitseq (0.7.5+dfsg-4)

[ Source: bitseq  ]

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

Інші пакунки пов'язані з bitseq

• dep: libc6 (>= 2.23)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, i386]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: python

  Інтерактивна об'єктно-орієнтована мова високого рівня (гілка 2.x)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Завантажити bitseq

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	340.3 kB	1,879.0 kB	[список файлів]
arm64	299.8 kB	1,655.0 kB	[список файлів]
armhf	285.3 kB	1,090.0 kB	[список файлів]
i386	359.3 kB	1,910.0 kB	[список файлів]