Paketti: bitseq (0.7.5+dfsg-4)

[ Source: bitseq  ]

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

Muut pakettiin bitseq liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.23)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, i386]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: python

  interactive high-level object-oriented language (Python2 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Imuroi bitseq

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	340.3 kt	1,879.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	299.8 kt	1,655.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	285.3 kt	1,090.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	359.3 kt	1,910.0 kt	[tiedostoluettelo]