[ Source: cnvkit ]
Пакунок: cnvkit (0.9.5-3)
Links for cnvkit
Debian Resources:
Download Source Package cnvkit:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Olivier Sallou (QA Page)
External Resources:
- Homepage [cnvkit.readthedocs.org]
Similar packages:
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
A command-line toolkit and Python library for detecting copy number variants and alterations genome-wide from targeted DNA sequencing. It is designed for use with hybrid capture, including both whole-exome and custom target panels, and short-read sequencing platforms such as Illumina and Ion Torrent.
Інші пакунки пов'язані з cnvkit
|
|
|
|
-
- dep: python3
- Інтерактивна об'єктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)
-
- dep: python3-biopython
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 3)
-
- dep: python3-future
- Clean single-source support for Python 3 and 2 - Python 3.x
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-numpy
- Швидкі методи для роботи з числовими масивами для мови Python 3
-
- dep: python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data - Python 3
-
- dep: python3-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python 3
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: python3-reportlab
- Бібліотека ReportLab для створення PDF-документів за допомогою Python3
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: r-bioc-dnacopy
- R package: DNA copy number data analysis
Завантажити cnvkit
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| amd64 | 22,378.8 kB | 22,874.0 kB | [список файлів] |