Balík: cnvkit (0.9.5-3)

[ Zdroj: cnvkit  ]

Copy number variant detection from targeted DNA sequencing

A command-line toolkit and Python library for detecting copy number variants and alterations genome-wide from targeted DNA sequencing. It is designed for use with hybrid capture, including both whole-exome and custom target panels, and short-read sequencing platforms such as Illumina and Ion Torrent.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom cnvkit

• dep: python3

  interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (predvolená verzia python3)

• dep: python3-biopython

  knižnica na bioinformatiku implementovaná v jazyku Python 3

• dep: python3-future

  podpora Python 3 a 2 v rámci jedného zdrojového kódu - Python 3.x

• dep: python3-matplotlib

  systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu - Python 3

• dep: python3-numpy

  schopnosti rýchlych polí do jazyka Python 3

• dep: python3-pandas

  údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“ - Python 3

• dep: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: python3-reportlab

  knižnica ReportLab na tvorbu dokumentov PDF pomocou Pythonu

• dep: python3-scipy

  vedecké nástroje pre Python 3

• dep: r-bioc-dnacopy

  R package: DNA copy number data analysis

Stiahnuť cnvkit

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	22,378.8 kB	22,874.0 kB	[zoznam súborov]