Пакунок: grabix (0.1.7-2)

[ Source: grabix  ]

wee tool for random access into BGZF files

In biomedical research it is increasing practice to study the genetic basis of disease. This now frequently comprises the sequencing of human sequences. The output of the machine however is redundant, and the real sequence is the best sequence to explain the redundancy. The exchange of data happens only with compressed files - to huge and redundant to perform otherwise. One should avoid uncompression whenever possible.

grabix leverages the fantastic BGZF library of the samtools package to provide random access into text files that have been compressed with bgzip. grabix creates it's own index (.gbi) of the bgzipped file. Once indexed, one can extract arbitrary lines from the file with the grab command. Or choose random lines with the, well, random command.

Інші пакунки пов'язані з grabix

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1) [not armel, armhf]

  Пакунок недоступний

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: tabix

  generic indexer for TAB-delimited genome position files

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити grabix

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	14.4 kB	56.0 kB	[список файлів]
arm64	13.9 kB	52.0 kB	[список файлів]
armel	15.0 kB	51.0 kB	[список файлів]
armhf	14.4 kB	43.0 kB	[список файлів]
i386	15.8 kB	55.0 kB	[список файлів]
mips64el	15.0 kB	53.0 kB	[список файлів]
mipsel	16.1 kB	52.0 kB	[список файлів]
ppc64el	14.9 kB	92.0 kB	[список файлів]