Пакунок: python3-pairtools-examples (1.0.2-2 and others)

[ Source: pairtools  ]

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Інші пакунки пов'язані з python3-pairtools-examples

• enh: python3-pairtools

  Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Завантажити python3-pairtools-examples

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
mips64el	1.0.2-2+b1	484.1 kB	539.0 kB	[список файлів]