Пакунок: flexbar (1:3.5.0-5)

[ Source: flexbar  ]

flexible barcode and adapter removal for sequencing platforms

Flexbar preprocesses high-throughput sequencing data efficiently. It demultiplexes barcoded runs and removes adapter sequences. Moreover, trimming and filtering features are provided. Flexbar increases mapping rates and improves genome and transcriptome assemblies. It supports next-generation sequencing data in fasta/q and csfasta/q format from Illumina, Roche 454, and the SOLiD platform.

Parameter names changed in Flexbar. Please review scripts. The recent months, default settings were optimised, several bugs were fixed and various improvements were made, e.g. revamped command-line interface, new trimming modes as well as lower time and memory requirements.

Інші пакунки пов'язані з flexbar

• dep: libbz2-1.0

  Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]

  parallelism library for C++ - runtime files

  dep: libtbb12 (>= 2021.8.0) [not amd64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити flexbar

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	347.6 kB	1,165.0 kB	[список файлів]
arm64	298.4 kB	1,149.0 kB	[список файлів]
armel	288.9 kB	1,040.0 kB	[список файлів]
armhf	299.0 kB	820.0 kB	[список файлів]
i386	353.1 kB	1,184.0 kB	[список файлів]
mips64el	285.8 kB	1,321.0 kB	[список файлів]
mipsel	287.4 kB	1,314.0 kB	[список файлів]
ppc64el	336.8 kB	1,341.0 kB	[список файлів]
s390x	302.9 kB	1,185.0 kB	[список файлів]