tüm seçenekler
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: python-pyfaidx  ]

Paket: python3-pyfaidx (0.8.1.3-1)

python3-pyfaidx için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

python-pyfaidx Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

efficient random access to fasta subsequences for Python 3

Samtools provides a function "faidx" (FAsta InDeX), which creates a small flat index file ".fai" allowing for fast random access to any subsequence in the indexed FASTA file, while loading a minimal amount of the file in to memory. This Python module implements pure Python classes for indexing, retrieval, and in-place modification of FASTA files using a samtools compatible index. The pyfaidx module is API compatible with the pygr seqdb module. A command-line script "faidx" is installed alongside the pyfaidx module, and facilitates complex manipulation of FASTA files without any programming knowledge.

This package provides the Python 3 modules to access fasta files.

python3-pyfaidx ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

python3-pyfaidx indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
all 28,4 kB125,0 kB [dosya listesi]