Paket: pizzly (0.37.3+ds-10) [debports]

[ Kaynak:  ]

Deneysel paket

Uyarı: Bu paket deneysel dağıtımdan geliyor. Bu, paketin kararsız veya hatalı olabileceği hatta veri kaybına sebep olabileceği anlamına gelmektedir. Lütfen kullanmadan önce değişim günlüğüne ve muhtemel diğer belgelendirmeye danıştığınızdan emin olun.

Identifies gene fusions in RNA sequencing data

For the interpretation of the transcriptome (the abundance and sequence of RNA) of tomour cells one is particularly interested in transcripts that cannot be mapped to single genes but that are seen to be fused as parts from two genes. Likely eplanations are chromosomal translocations.

Pizzly can identify novel such peculiarities, building on interpretations on variable splicing by the tool kallisto. Both tools are elements of the bcbio workflow.

pizzly ile İlgili Diğer Paketler

• dep: kallisto

  near-optimal RNA-Seq quantification

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.3)

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

• rec: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

pizzly indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
sparc64 (resmi olmayan port)	240,1 kB	1.062,0 kB	[dosya listesi]