Paket: r-bioc-oligo (1.70.0+ds-1) [debports]

[ Kaynak:  ]

Deneysel paket

Uyarı: Bu paket deneysel dağıtımdan geliyor. Bu, paketin kararsız veya hatalı olabileceği hatta veri kaybına sebep olabileceği anlamına gelmektedir. Lütfen kullanmadan önce değişim günlüğüne ve muhtemel diğer belgelendirmeye danıştığınızdan emin olun.

Preprocessing tools for oligonucleotide arrays

A package to analyze oligonucleotide arrays (expression/SNP/tiling/exon) at probe-level. It currently supports Affymetrix (CEL files) and NimbleGen arrays (XYS files).

r-bioc-oligo ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  Paket mevcut değil

• dep: r-api-bioc-3.20

  Paket mevcut değil

• dep: r-bioc-affxparser (>= 1.39.4)

  Affymetrix File Parsing SDK

• dep: r-bioc-affyio (>= 1.35.0)

  BioConductor tools for parsing Affymetrix data files

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.27.3)

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.11)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.35.12)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.29.6)

  Classes for high-throughput arrays supported by oligo and crlmm

• dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.29.0)

  BioConductor collection of pre-processing functions

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

  GNU R package providing a generic database interface

• dep: r-cran-ff

  Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data

• dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

  Database Interface R driver for SQLite

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biomart

  GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)

• sug: r-bioc-genefilter

  methods for filtering genes from microarray experiments

• sug: r-bioc-limma

  linear models for microarray data

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R package providing suitable color palettes

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

r-bioc-oligo indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
ppc64 (resmi olmayan port)	901,0 kB	1.417,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	894,8 kB	2.314,0 kB	[dosya listesi]