tüm seçenekler
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: damapper  ]

Paket: damapper (0.0+git20210330.ab45103-1)

damapper için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

damapper Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

damapper ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

damapper indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
amd64 103,6 kB304,0 kB [dosya listesi]
arm64 93,1 kB284,0 kB [dosya listesi]
armel 94,8 kB298,0 kB [dosya listesi]
armhf 94,4 kB218,0 kB [dosya listesi]
i386 106,5 kB338,0 kB [dosya listesi]
mips64el 95,1 kB314,0 kB [dosya listesi]
mipsel 99,4 kB329,0 kB [dosya listesi]
ppc64el 109,2 kB428,0 kB [dosya listesi]
s390x 96,9 kB308,0 kB [dosya listesi]