Paket: bedtools (2.31.1+dfsg-2 och andra)
Länkar för bedtools
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet bedtools:
- [bedtools_2.31.1+dfsg-2.dsc]
- [bedtools_2.31.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [bedtools_2.31.1+dfsg-2.debian.tar.xz]
Ansvariga:
- Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
- Charles Plessy (QA-sida)
- Andreas Tille (QA-sida)
- Étienne Mollier (QA-sida)
Externa resurser:
- Hemsida [github.com]
Liknande paket:
suite of utilities for comparing genomic features
The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.
The groupBy utility is distributed in the filo package.
Andra paket besläktade med bedtools
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]
- GCC stödbibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- XZ-format compression library
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU standardbibliotek v3 för C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
Hämta bedtools
Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.31.1+dfsg-2 | 661,8 kbyte | 2.106,0 kbyte | [filförteckning] |
arm64 | 2.31.1+dfsg-2 | 574,4 kbyte | 2.006,0 kbyte | [filförteckning] |
armel | 2.31.1+dfsg-2 | 547,2 kbyte | 1.817,0 kbyte | [filförteckning] |
armhf | 2.31.1+dfsg-2 | 564,5 kbyte | 1.313,0 kbyte | [filförteckning] |
i386 | 2.31.1+dfsg-2 | 727,9 kbyte | 2.301,0 kbyte | [filförteckning] |
mips64el | 2.31.1+dfsg-2 | 582,9 kbyte | 2.599,0 kbyte | [filförteckning] |
ppc64el | 2.31.1+dfsg-2 | 664,1 kbyte | 2.518,0 kbyte | [filförteckning] |
riscv64 | 2.31.1+dfsg-2+b2 | 644,0 kbyte | 1.603,0 kbyte | [filförteckning] |
s390x | 2.31.1+dfsg-2 | 646,6 kbyte | 2.162,0 kbyte | [filförteckning] |