Paket: ipig (0.0.r5-4)

[ Källkod: ipig  ]

integrating PSMs into genome browser visualisations

iPiG targets the integration of peptide spectrum matches (PSMs) from mass spectrometry (MS) peptide identifications into genomic visualisations provided by genome browser such as the UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG takes PSMs from the MS standard format mzIdentML (*.mzid) or in text format and provides results in genome track formats (BED and GFF3 files), which can be easily imported into genome browsers.

Andra paket besläktade med ipig

• dep: libcommons-compress-java

  Java API for working with compression and archive formats

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libjdom1-java

  lightweight and fast library using XML

• dep: libxerces2-java

  Validating XML parser for Java with DOM level 3 support

Hämta ipig

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	160,9 kbyte	186,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	160,9 kbyte	186,0 kbyte	[filförteckning]
armel	160,9 kbyte	186,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	160,9 kbyte	186,0 kbyte	[filförteckning]
i386	160,9 kbyte	186,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	161,0 kbyte	186,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	160,9 kbyte	186,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	160,9 kbyte	186,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	160,9 kbyte	186,0 kbyte	[filförteckning]