Пакет: ipig (0.0.r5-4)

[ Источник: ipig  ]

integrating PSMs into genome browser visualisations

iPiG targets the integration of peptide spectrum matches (PSMs) from mass spectrometry (MS) peptide identifications into genomic visualisations provided by genome browser such as the UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG takes PSMs from the MS standard format mzIdentML (*.mzid) or in text format and provides results in genome track formats (BED and GFF3 files), which can be easily imported into genome browsers.

Другие пакеты, относящиеся к ipig

• dep: libcommons-compress-java

  Java API for working with compression and archive formats

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libjdom1-java

  lightweight and fast library using XML

• dep: libxerces2-java

  Validating XML parser for Java with DOM level 3 support

Загрузка ipig

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	160,9 Кб	186,0 Кб	[список файлов]
arm64	160,9 Кб	186,0 Кб	[список файлов]
armel	160,9 Кб	186,0 Кб	[список файлов]
armhf	160,9 Кб	186,0 Кб	[список файлов]
i386	160,9 Кб	186,0 Кб	[список файлов]
mips64el	161,0 Кб	186,0 Кб	[список файлов]
mipsel	160,9 Кб	186,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	160,9 Кб	186,0 Кб	[список файлов]
s390x	160,9 Кб	186,0 Кб	[список файлов]