Balík: seqan-raptor (3.0.1+ds-5 a iné)

[ Zdroj: seqan-raptor  ]

pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences

Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom seqan-raptor

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [arm64, ppc64el]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [nie arm64, ppc64el]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie arm64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0)

  YAML parser and emitter for C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• sug: cwl-runner

  virtuálny balík poskytovaný balíkom cwltool

Stiahnuť seqan-raptor

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	3.0.1+ds-5	646.1 kB	2,087.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	3.0.1+ds-5+b1	575.5 kB	1,976.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	3.0.1+ds-5	529.1 kB	2,319.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	3.0.1+ds-5	633.6 kB	2,359.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	3.0.1+ds-5+b1	620.9 kB	1,560.0 kB	[zoznam súborov]