[ Zdroj: skewer ]
Balík: skewer (0.2.2-6 a iné)
Odkazy pre skewer
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík skewer:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
post-processing of high-throughput DNA sequence reads
skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.
Features
* Detection and removal of adapter sequences * Insertion and deletion allowed in pattern matching * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads * Demultiplexing of barcoded sequencing runs * Multi-threading support * Trimming based on phred quality scores * IUPAC characters for barcodes and adapters * Compressed input and output support
Ostatné balíky súvisiace s balíkom skewer
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
Stiahnuť skewer
Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|---|
i386 | 0.2.2-6+b1 | 90.2 kB | 231.0 kB | [zoznam súborov] |