Balík: freebayes (1.3.9-1)

[ Zdroj: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom freebayes

• dep: libc6 (>= 2.38)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [nie amd64, ppc64el]

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [nie amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libtabixpp0t64 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.12+dfsg)

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• rec: parallel

  príprava a paralelné spúšťanie príkazových riadkov zo štandardného vstupu

Stiahnuť freebayes

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1,487.6 kB	4,126.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1,426.3 kB	4,045.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1,470.3 kB	4,437.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1,503.2 kB	4,430.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1,489.8 kB	3,774.0 kB	[zoznam súborov]