Zdrojový balík: roary (3.13.0+dfsg-1)
Odkazy pre roary
Zdroje Debian:
Správcovia:
Externé zdroje:
Nasledovné binárne balíky sú zostavované z tohto zdrojového balíka:
- roary
- high speed stand alone pan genome pipeline
Ostatné balíky súvisiace s balíkom roary
-
- adep:
debhelper
(>= 12~)
- pomocné programy pre debian/rules
-
- adep:
dh-dist-zilla
- debhelper add-on to call dzil build and clean up after the build
-
- adep:
libdist-zilla-plugin-podweaver-perl
- Dist::Zilla plugin to use Pod::Weaver to generate Pod documentation
-
- adep:
bioperl
(>= 1.7.4)
- nástroje jazyka Perl na výpočtovú molekulárnu biológiu
-
- adep:
libarray-utils-perl
- collection of small utils for array manipulation
-
- adep:
libenv-path-perl
- Perl module implementing advanced operations on path variables
-
- adep:
libexception-class-perl
- modul jazyka Perl, ktorý vám umožňuje deklarovať skutočné triedy výnimiek
-
- adep:
libfile-find-rule-perl
- modul na hľadanie súborov na základe pravidiel
-
- adep:
libfile-grep-perl
- module for pattern matching in a series of files
-
- adep:
libfile-slurper-perl
- jednoduchý, rozumný a efektívny modul na sťahovanie súborov
-
- adep:
libfile-which-perl
- modul Perlu na nájdenie ciest k spustiteľným programom
-
- adep:
libfindbin-libs-perl
- Perl module to use a relative path for lib directories
-
- adep:
libgraph-perl
- Perl module for graph data structures and algorithms
-
- adep:
libgraph-readwrite-perl
- module for reading and writing directed graphs
-
- adep:
liblog-log4perl-perl
- Perl port of the widely popular log4j logging package
-
- adep:
libmoose-perl
- moderná platforma objektového systému jazyka Perl
-
- adep:
libperlio-utf8-strict-perl
- fast and correct UTF-8 Perl IO module
-
- adep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
-
- adep:
libtest-file-perl
- Perl module to test file attributes
-
- adep:
libtest-files-perl
- module to ease testing with files and directories
-
- adep:
libtest-output-perl
- perl module to test stdout and stderr messages
-
- adep:
libtext-csv-perl
- manipulátor súborov CSV (pomocou XS alebo PurePerl)
-
- adep:
bedtools
- suite of utilities for comparing genomic features
-
- adep:
cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- adep:
ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- adep:
mcl
- Markov Cluster algorithm
-
- adep:
parallel
- príprava a paralelné spúšťanie príkazových riadkov zo štandardného vstupu
-
- adep:
prank
- Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
-
- adep:
r-base-core
- jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém
-
- adep:
mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- adep:
fasttree
- phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
-
- idep:
perl
- Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla