Quellcode-Paket: roary (3.13.0+dfsg-1)
Links für roary
Debian-Ressourcen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
Die folgenden Binärpakete werden aus diesem Quellcode-Paket gebaut:
- roary
- high speed stand alone pan genome pipeline
Andere Pakete mit Bezug zu roary
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- adep:
debhelper
(>= 12~)
- Hilfsprogramme für debian/rules
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- adep:
dh-dist-zilla
- Debhelper-Add-on zum Aufrufen von dzil build und dzil clean nach dem Build
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- adep:
libdist-zilla-plugin-podweaver-perl
- Dist::Zilla plugin to use Pod::Weaver to generate Pod documentation
-
- adep:
bioperl
(>= 1.7.4)
- Perl-Werkzeuge für bioinformatische Anwendungen
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- adep:
libarray-utils-perl
- collection of small utils for array manipulation
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- adep:
libenv-path-perl
- Perl module implementing advanced operations on path variables
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- adep:
libexception-class-perl
- Modul, das echte Perl-Klassen zur Behandlung von Ausnahmen deklarieren kann
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- adep:
libfile-find-rule-perl
- Modul zur regelbasierten Suche nach Dateien
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- adep:
libfile-grep-perl
- module for pattern matching in a series of files
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- adep:
libfile-slurper-perl
- simple, sane and efficient module to slurp a file
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- adep:
libfile-which-perl
- Perl-Modul zum Durchsuchen des Pfads nach ausführbaren Programmen
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- adep:
libfindbin-libs-perl
- Perl module to use a relative path for lib directories
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- adep:
libgraph-perl
- Perl module for graph data structures and algorithms
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- adep:
libgraph-readwrite-perl
- module for reading and writing directed graphs
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- adep:
liblog-log4perl-perl
- Perl-Portierung des sehr populären Protokollierungspakets log4j
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- adep:
libmoose-perl
- Modernes Rahmenwerk für das Perl-Objektsystem
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- adep:
libperlio-utf8-strict-perl
- fast and correct UTF-8 Perl IO module
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- adep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
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- adep:
libtest-file-perl
- Perl module to test file attributes
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- adep:
libtest-files-perl
- module to ease testing with files and directories
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- adep:
libtest-output-perl
- perl module to test stdout and stderr messages
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- adep:
libtext-csv-perl
- Manipulator für komma-getrennte Werte (mittels XS oder reinem Perl)
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- adep:
bedtools
- Hilfswerkzeugsammlung zum Vergleich genomischer Merkmale
-
- adep:
cd-hit
- Programme zur schnellen Gruppierung von Sequenzen
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- adep:
ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- adep:
mcl
- Markov-Cluster-Algorithmus
-
- adep:
parallel
- build and execute command lines from standard input in parallel
-
- adep:
prank
- Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
-
- adep:
r-base-core
- GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
-
- adep:
mafft
- Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen
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- adep:
fasttree
- phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
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- idep:
perl
- Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
