Balík: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-1 a iné) [debports]

[ Zdroj:  ]

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom fml-asm

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  pomocná knižnica poskytujúca zabudované funkcie __atomic

• dep: libc6 (>= 2.40)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť fml-asm

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
sh4 (neoficiálny port)	0.1+git20190320.b499514-1+b2	91.3 kB	211.0 kB	[zoznam súborov]