Paketti: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-1 ja muut) [debports]

[ Source:  ]

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Muut pakettiin fml-asm liittyvät paketit

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  support library providing __atomic built-in functions

• dep: libc6 (>= 2.40)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi fml-asm

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
sh4 (epävirallinen siirros)	0.1+git20190320.b499514-1+b2	91.3 kt	211.0 kt	[tiedostoluettelo]