Balík: mcaller (1.0.3+git20210624.b415090-3)

[ Zdroj: mcaller  ]

find methylation in nanopore reads

   H
   |
 H-C-aller
   |
   H

This program is designed to call m6A from nanopore data using the differences between measured and expected currents.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom mcaller

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-matplotlib

  systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-pandas

  údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: python3-scipy

  vedecké nástroje pre Python 3

• dep: python3-seaborn

  statistical visualization library for Python3

• dep: python3-sklearn

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• rec: nanopolish

  consensus caller for nanopore sequencing data

  alebo poretools

  toolkit for nanopore nucleotide sequencing data

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: graphmap

  Balík nie je dostupný

Stiahnuť mcaller

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	18.5 kB	83.0 kB	[zoznam súborov]