Balík: python3-cooler (0.10.2-1 a iné)

[ Zdroj: python-cooler  ]

library for a sparse, compressed, binary persistent storage

Cooler is a support library for a sparse, compressed, binary persistent storage format, also called cooler, used to store genomic interaction data, such as Hi-C contact matrices.

The cooler file format is an implementation of a genomic matrix data model using HDF5 as the container format. The cooler package includes a suite of command line tools and a Python API to facilitate creating, querying and manipulating cooler files.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-cooler

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-asciitree

  Draw tree structures using (ASCII or Unicode) characters

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-cytoolz

  Toolz in Cython: High performance functional utilities

• dep: python3-h5py (>= 2.5)

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-multiprocess

  better multiprocessing and multithreading in Python

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-pairix

  1D/2D indexing and querying with a pair of genomic coordinates

• dep: python3-pandas [ppc64]

  údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“

  dep: python3-pandas (>= 2.1) [nie ppc64]

• dep: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: python3-scipy (>= 1.10~)

  vedecké nástroje pre Python 3

• dep: python3-simplejson

  jednoduchý, rýchly a rozšíriteľný kodér/dekodér JSON pre Python 3.x

• dep: python3-six [ppc64]

  Python 2 and 3 compatibility library

• dep: python3-yaml

  spracovanie a tvorbu YAML v jazyku Python 3

• rec: python3-dask

  Minimal task scheduling abstraction for Python 3

• sug: python3-pip

  inštalátor balíkov Pythonu

Stiahnuť python3-cooler

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	0.10.2-1	85.9 kB	399.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	0.10.2-1	85.9 kB	399.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.10.2-1	85.9 kB	399.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.10.2-1	85.9 kB	399.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	0.9.1-1	83.7 kB	383.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.10.2-1	85.9 kB	399.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	0.10.2-1	85.9 kB	399.0 kB	[zoznam súborov]