Balík: murasaki-mpi (1.68.6-13 a iné) [debports]
Odkazy pre murasaki-mpi
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík :
NenájdenýSprávcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
Podobné balíky:
homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)
Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.
Murasaki is an anchor alignment software, which is
* exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with 40 nodes: 52 wall minutes)) * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI. Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.) * unlimited pattern length * repeat tolerant * intelligent noise reduction
This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom murasaki-mpi
|
|
|
|
-
- dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)
- operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++
-
- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)
- knižnica Boost.Iostreams
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: murasaki-common
- homology detection tool across multiple large genomes (common files)
Stiahnuť murasaki-mpi
Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|---|
ppc64 (neoficiálny port) | 1.68.6-13+b5 | 715.8 kB | 7,143.0 kB | [zoznam súborov] |