Balík: bowtie2 (2.4.5-1) [debports]
Odkazy pre bowtie2
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík :
NenájdenýSprávcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [bowtie-bio.sourceforge.net]
Podobné balíky:
ultrafast memory-efficient short read aligner
is an ultrafast and memory-efficient tool for aligning sequencing reads to long reference sequences. It is particularly good at aligning reads of about 50 up to 100s or 1,000s of characters, and particularly good at aligning to relatively long (e.g. mammalian) genomes.
Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index to keep its memory footprint small: for the human genome, its memory footprint is typically around 3.2 GB. Bowtie 2 supports gapped, local, and paired-end alignment modes
Ostatné balíky súvisiace s balíkom bowtie2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.33)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: perl
- Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
-
- sug: bowtie2-examples
- Examples for bowtie2
Stiahnuť bowtie2
Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|
ppc64 (neoficiálny port) | 1,346.4 kB | 5,825.0 kB | [zoznam súborov] |