Пакет: bowtie2 (2.4.5-1) [debports]
Ссылки для bowtie2
Ресурсы Debian:
Исходный код :
Не найденСопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [bowtie-bio.sourceforge.net]
Подобные пакеты:
ultrafast memory-efficient short read aligner
is an ultrafast and memory-efficient tool for aligning sequencing reads to long reference sequences. It is particularly good at aligning reads of about 50 up to 100s or 1,000s of characters, and particularly good at aligning to relatively long (e.g. mammalian) genomes.
Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index to keep its memory footprint small: for the human genome, its memory footprint is typically around 3.2 GB. Bowtie 2 supports gapped, local, and paired-end alignment modes
Другие пакеты, относящиеся к bowtie2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.33)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- библиотека сжатия
-
- sug: bowtie2-examples
- Examples for bowtie2
Загрузка bowtie2
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
ppc64 (неофициальный перенос) | 1 346,4 Кб | 5 825,0 Кб | [список файлов] |