Balík: r-bioc-edger (4.4.1+dfsg-1)

[ Zdroj: r-bioc-edger  ]

Experimentálny balík

Upozornenie: Tento balík pochádza z distribúcie experimental. To znamená, že je pravdepodobne nestabilný alebo môže dokonca spôsobiť stratu údajov. Predtým, než ho začnete používať sa prosím pozrite do záznamu zmien a ďalšej možnej dokumentácie.

Empirical analysis of digital gene expression data in R

Bioconductor package for differential expression analysis of whole transcriptome sequencing (RNA-seq) and digital gene expression profiles with biological replication. It uses empirical Bayes estimation and exact tests based on the negative binomial distribution. It is also useful for differential signal analysis with other types of genome-scale count data.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::r, interface::commandline, Role: Program

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-edger

• dep: libblas3

  referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

  alebo libblas.so.3

  Balík nie je dostupný

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: liblapack3

  knižnica rutín lineárnej algebry, verzia 3 - zdieľaná knižnica

  alebo liblapack.so.3

  Balík nie je dostupný

• dep: r-api-4.0

  Balík nie je dostupný

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-limma (>= 3.61.9)

  linear models for microarray data

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• sug: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

  genome-wide annotation for Human

• sug: r-bioc-rhdf5

  BioConductor HDF5 interface to R

• sug: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-jsonlite

  robustný, výkonný nástroj na tvorbu a spracovanie JSON pre R

• sug: r-cran-knitr

  balík GNU R na dynamickú tvorbu zostáv pomocou Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  balík tried GNU R pre husté a riedke matice

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-seuratobject

  GNU R data structures for single cell data

Stiahnuť r-bioc-edger

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1,090.2 kB	1,317.0 kB	[zoznam súborov]