Пакет: r-bioc-edger (4.4.1+dfsg-1)

[ Источник: r-bioc-edger  ]

Экспериментальный пакет

Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.

Empirical analysis of digital gene expression data in R

Bioconductor package for differential expression analysis of whole transcriptome sequencing (RNA-seq) and digital gene expression profiles with biological replication. It uses empirical Bayes estimation and exact tests based on the negative binomial distribution. It is also useful for differential signal analysis with other types of genome-scale count data.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::r, interface::commandline, Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к r-bioc-edger

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  Пакет недоступен

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: liblapack3

  библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия

  или liblapack.so.3

  Пакет недоступен

• dep: r-api-4.0

  Пакет недоступен

• dep: r-api-bioc-3.20

  виртуальный пакет, предоставляемый r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-limma (>= 3.61.9)

  linear models for microarray data

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• sug: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

  genome-wide annotation for Human

• sug: r-bioc-rhdf5

  BioConductor HDF5 interface to R

• sug: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-seuratobject

  GNU R data structures for single cell data

Загрузка r-bioc-edger

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1 090,2 Кб	1 317,0 Кб	[список файлов]