Balík: sniffles (1.0.11+ds-1)

[ Zdroj: sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom sniffles

• dep: libbamtools2.5.1

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nie armhf]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

Stiahnuť sniffles

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	186.2 kB	621.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	167.5 kB	529.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	166.5 kB	376.0 kB	[zoznam súborov]
i386	200.6 kB	652.0 kB	[zoznam súborov]