Paquet : sniffles (1.0.11+ds-1)

[ Paquet source : sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Autres paquets associés à sniffles

• dep: libbamtools2.5.1

  bibliothèque dynamique de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [non armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• sug: bwa

  dispositif d'alignement Burrows-Wheeler

Télécharger sniffles

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	186,2 ko	621,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	167,5 ko	529,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	166,5 ko	376,0 ko	[liste des fichiers]
i386	200,6 ko	652,0 ko	[liste des fichiers]