Balík: cassiopee (1.0.9-2)

[ Zdroj: cassiopee  ]

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom cassiopee

• dep: libboost-iostreams1.67.0

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.67.0 (>= 1.67.0-10)

  knižnica regulárnych výrazov pre C++

• dep: libboost-serialization1.67.0

  knižnica na serializáciu pre C++

• dep: libc6 (>= 2.4)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libcassie1v5

  library implementating search algorithms

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  podporná knižnica GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgoogle-glog0v5

  library that implements application-level logging.

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

Stiahnuť cassiopee

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
i386	17.8 kB	65.0 kB	[zoznam súborov]