Pakiet: cassiopee (1.0.9-2)

[ Pakiet źródłowy: cassiopee  ]

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

Inne pakiety związane z cassiopee

• dep: libboost-iostreams1.67.0

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.67.0 (>= 1.67.0-10)

  regular expression library for C++

• dep: libboost-serialization1.67.0

  serialization library for C++

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libcassie1v5

  library implementating search algorithms

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgoogle-glog0v5

  library that implements application-level logging.

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie cassiopee

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	17,8 KiB	65,0 KiB	[lista plików]