Balík: gromacs-openmpi (2019.1-1)

[ Zdroj: gromacs  ]

Molecular dynamics sim, binaries for OpenMPI parallelization

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains only the core simulation engine with parallel support using the OpenMPI interface. It is suitable for nodes of a processing cluster, or for multiprocessor machines.

Značky: Software Development: Vývoj v C, Knižnice, Pole: Biológia, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::devel-lib, role::program, Scope: Utility, Works with: Packaged Software

Ostatné balíky súvisiace s balíkom gromacs-openmpi

• dep: libc6 (>= 2.27) [amd64, arm64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.28) [armhf, i386]

• dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

  knižnica na výpočet rýchlych fourierovych transformácií - dvojitá presnosť

• dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

  knižnica na počítanie rýchlych fourierovych transformácií - jednoduchá presnosť

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhwloc5 (>= 1.11.12)

  hierarchický pohľad na počítač - zdieľané knižnice

• dep: libopenmpi3

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [amd64, i386]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 6) [arm64, armhf]

• dep: openmpi-bin (>= 1.2.3)

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spustiteľné súbory

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• rec: gromacs

  Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

• sug: gromacs-data

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

Stiahnuť gromacs-openmpi

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	8,052.7 kB	23,271.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	5,660.2 kB	14,917.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	3,507.6 kB	8,937.0 kB	[zoznam súborov]
i386	6,789.0 kB	22,189.0 kB	[zoznam súborov]