Balík: mmseqs2 (14-7e284+ds-1 a iné)

[ Zdroj: mmseqs2  ]

ultra fast and sensitive protein search and clustering

MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) is a software suite to search and cluster huge proteins/nucleotide sequence sets. MMseqs2 is open source GPL-licensed software implemented in C++ for Linux, MacOS, and (as beta version, via cygwin) Windows. The software is designed to run on multiple cores and servers and exhibits very good scalability. MMseqs2 can run 10000 times faster than BLAST. At 100 times its speed it achieves almost the same sensitivity. It can perform profile searches with the same sensitivity as PSI-BLAST at over 400 times its speed.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom mmseqs2

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  pomocná knižnica poskytujúca zabudované funkcie __atomic

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  podporná knižnica GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

  provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť mmseqs2

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
mips64el	14-7e284+ds-1+b2	6,858.7 kB	16,543.0 kB	[zoznam súborov]