Пакет: adapterremoval (2.3.3-2)

[ Источник: adapterremoval  ]

rapid adapter trimming, identification, and read merging of gene sequences

This program searches for and removes remnant adapter sequences from High- Throughput Sequencing (HTS) data and (optionally) trims low quality bases from the 3' end of reads following adapter removal. AdapterRemoval can analyze both single end and paired end data, and can be used to merge overlapping paired-ended reads into (longer) consensus sequences. Additionally, the AdapterRemoval may be used to recover a consensus adapter sequence for paired-ended data, for which this information is not available.

Другие пакеты, относящиеся к adapterremoval

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка adapterremoval

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	186,3 Кб	530,0 Кб	[список файлов]
arm64	163,7 Кб	486,0 Кб	[список файлов]
armel	152,1 Кб	485,0 Кб	[список файлов]
armhf	158,2 Кб	357,0 Кб	[список файлов]
i386	195,3 Кб	553,0 Кб	[список файлов]
mips64el	168,6 Кб	636,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	188,9 Кб	614,0 Кб	[список файлов]
s390x	160,8 Кб	526,0 Кб	[список файлов]