Пакет: libbio-db-hts-perl (3.01-4 и другие)

[ Источник: libbio-db-hts-perl  ]

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Другие пакеты, относящиеся к libbio-db-hts-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [не armhf]

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

  dep: perl (>= 5.38.2-3.2+b1) [armhf]

• dep: perlapi-5.38.2 [не armel, armhf]

  виртуальный пакет, предоставляемый perl-base

• dep: perlapi-5.38.2t64 [armel, armhf]

  виртуальный пакет, предоставляемый perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  библиотека сжатия

Загрузка libbio-db-hts-perl

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3.01-4+b3	135,8 Кб	426,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.01-4+b3	130,5 Кб	533,0 Кб	[список файлов]
armel	3.01-4+b3	132,4 Кб	413,0 Кб	[список файлов]
armhf	3.01-4+b3	131,4 Кб	373,0 Кб	[список файлов]
i386	3.01-4+b3	137,1 Кб	441,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3.01-4+b3	126,1 Кб	542,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3.01-4+b3	133,3 Кб	534,0 Кб	[список файлов]
s390x	3.01-4+b3	136,2 Кб	439,0 Кб	[список файлов]