Paketti: libbio-db-hts-perl (3.01-5)

[ Source: libbio-db-hts-perl  ]

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Muut pakettiin libbio-db-hts-perl liittyvät paketit

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: perl (>= 5.40.0-6)

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• dep: perlapi-5.40.0

  näennäispaketti, jonka toteuttaa perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libbio-db-hts-perl

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	139.1 kt	428.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	133.7 kt	477.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	135.2 kt	415.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	134.5 kt	375.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	140.9 kt	447.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	129.6 kt	548.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	136.6 kt	540.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	139.5 kt	403.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	139.3 kt	441.0 kt	[tiedostoluettelo]