[ Источник: smrtanalysis ]
Пакет: smrtanalysis (0~20210112)
Ссылки для smrtanalysis
Ресурсы Debian:
Исходный код smrtanalysis:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [www.pacb.com]
Подобные пакеты:
software suite for single molecule, real-time sequencing
SMRT® Analysis is a powerful, open-source bioinformatics software suite available for analysis of DNA sequencing data from Pacific Biosciences’ SMRT technology. Users can choose from a variety of analysis protocols that utilize PacBio® and third-party tools. Analysis protocols include de novo genome assembly, cDNA mapping, DNA base-modification detection, and long-amplicon analysis to determine phased consensus sequences.
This is a metapackage that depends on the components of SMRT Analysis.
Другие пакеты, относящиеся к smrtanalysis
|
|
|
|
-
- dep: blasr
- mapping single-molecule sequencing reads
-
- dep: pbbamtools
- processing Pacific Biosciences binary alignment/map files
-
- dep: pbdagcon
- sequence consensus using directed acyclic graphs
-
- sug: falcon
- Пакет недоступен
-
- sug: kineticstools
- detection of DNA modifications
-
- sug: pbalign
- Пакет недоступен
-
- sug: pbbarcode
- Пакет недоступен
-
- sug: pbgenomicconsensus
- Пакет недоступен
-
- sug: pbh5tools
- Пакет недоступен
Загрузка smrtanalysis
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| all | 3,1 Кб | 9,0 Кб | [список файлов] |