Pakiet: smrtanalysis (0~20210112)

[ Pakiet źródłowy: smrtanalysis  ]

software suite for single molecule, real-time sequencing

SMRT® Analysis is a powerful, open-source bioinformatics software suite available for analysis of DNA sequencing data from Pacific Biosciences’ SMRT technology. Users can choose from a variety of analysis protocols that utilize PacBio® and third-party tools. Analysis protocols include de novo genome assembly, cDNA mapping, DNA base-modification detection, and long-amplicon analysis to determine phased consensus sequences.

This is a metapackage that depends on the components of SMRT Analysis.

Inne pakiety związane z smrtanalysis

• dep: blasr

  mapping single-molecule sequencing reads

• dep: pbbamtools

  processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

• dep: pbdagcon

  sequence consensus using directed acyclic graphs

• sug: falcon

  Pakiet niedostępny

• sug: kineticstools

  detection of DNA modifications

• sug: pbalign

  Pakiet niedostępny

• sug: pbbarcode

  Pakiet niedostępny

• sug: pbgenomicconsensus

  Pakiet niedostępny

• sug: pbh5tools

  Pakiet niedostępny

Pobieranie smrtanalysis

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	3,1 KiB	9,0 KiB	[lista plików]