Пакет: libhts3t64 (1.19+ds-1.1 и другие) [debports]

[ Источник:  ]

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

Другие пакеты, относящиеся к libhts3t64

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  удобная библиотека для передачи данных клиента по URL (GnuTLS)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  быстрое сжатие и распаковка блоков данных на основе DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  библиотека для работы с архивами в формате XZ

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  инструментарий Secure Sockets Layer — разделяемые библиотеки

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка libhts3t64

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
ia64 (неофициальный перенос)	1.19+ds-1.1+b1	550,8 Кб	2 073,0 Кб	[список файлов]