Пакет: bedtools (2.31.1+dfsg-2) [debports]

[ Источник:  ]

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Другие пакеты, относящиеся к bedtools

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  библиотека для работы с архивами в формате XZ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка bedtools

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
ia64 (неофициальный перенос)	796,8 Кб	4 272,0 Кб	[список файлов]