パッケージ: bedtools (2.31.1+dfsg-2) [debports]
suite of utilities for comparing genomic features
The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.
The groupBy utility is distributed in the filo package.
その他の bedtools 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6.1 (>= 2.37)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- XZ 形式の圧縮ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libunwind8
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム